1、过滤精度不同

纳滤膜的过滤精度介于反渗透膜和超滤膜之间，能截留有机物的分子量大约为200~400左右。反渗透是最精密的膜法液体分离技术，它能阻挡所有溶解性盐分子量大于100的有机物，由于过滤精度高，可以滤除水中的细菌和各种杂质。

2、孔径不同

纳滤膜的孔径在1纳米以上，一般1-2纳米，能截留大于0.001微米的物质；反渗透膜孔径在0.1~0.7纳米之间，能截留大于0.0001微米的物质。

3、脱盐率不同

纳滤系统采用的是错流过滤方式，脱盐率在80%到90%之间，主要应用于大分子物质浓缩和纯化。反渗透技术的脱盐率在99.5%，能有效截流所有溶解盐分及各种分子量大于100的有机物，同时允许小分子通过。

4、产生的“废水”比例不同

反渗透和纳滤都是通过加压、加电的方式净化水。但反渗透技术由于膜的构成不同，反渗透产生的废水在1:2.1:3，纳滤的废水比在1:1，反渗透产生的废水比例较大。

5、用途不同

纳滤膜用于过滤精度要求稍低的环境，一般用于水软化、微污染脱盐率和工业纯水的制造。反渗透膜一般用于家庭纯净水、工业超纯水和医疗超纯水的制造。